Gra stworzona przez studio Dimps i wydana na konsolę nintendo Gameboy advance. Jest ostatnią grą w serii.
Robotnik zdobywa wszystkie szmaragdy i za pomocą nich rozdziela świat na siedem części. Oprócz tego tworzy gezoida Gemerla. Sonic i ekipa postanawiają pokonać doktora.
Rozgrywka jest podobna do poprzednich części. Z tym, że dodano mechanikę duetów. Od teraz musimy stworzyć duet postaci, który wpływa na sposób rozgrywki. Są trzy rodzaje duetów:
Gra jest podzielona na siedem stref podzielonych na trzy akty i walkę z bossem. Każda ze stref posiada swój hub. Uzbieranie wszystkich szmaragdów daje możliwość walki z sekretnym bossem. Aby je zdobyć należy przejść specjalne plansze odblokowywane poprzez zebrania wszystkich Chao ze stref i klucza.